Les scientifiques en bioinformatique d'Arc @noamteyssier et @a_dobin viennent de lancer cyto, un processeur à très haut débit spécifiquement optimisé pour les données de cellules uniques @10xGenomics Flex. Nous sommes ravis de rendre cette ressource open source :

Lors des tests sur un ensemble de données Flex de 320 000 cellules, cyto a terminé le traitement en 13 minutes avec une utilisation de la mémoire et du disque considérablement inférieure tout en produisant des résultats presque identiques. Il est important de noter que ces gains proviennent de l'efficacité algorithmique, et non seulement du parallélisme.

À mesure que les ensembles de données unicellulaires se développent, les exigences de traitement augmentent. cyto tire parti de la structure fixe des bibliothèques Flex, permettant un traitement des données plus efficace et rendant la plateforme encore plus puissante pour les chercheurs. Écoutez-en parler par le développeur @noamteyssier :