Cientistas de bioinformática da Arc @noamteyssier e @a_dobin acabaram de lançar o cyto, um processador de ultra alta taxa especificamente otimizado para dados de célula única @10xGenomics Flex. Estamos animados em tornar esse recurso open source:
Em testes em um conjunto de dados Flex com 320.000 células, o cyto completou o processamento em 13 minutos com uso substancialmente menor de memória e disco, produzindo resultados quase idênticos. Importante, esses ganhos vêm da eficiência algorítmica, não apenas do paralelismo.
À medida que os conjuntos de dados de célula única aumentam, as demandas por processamento aumentam. O cyto aproveita a estrutura fixa das bibliotecas Flex, permitindo um processamento de dados mais eficiente e tornando a plataforma ainda mais poderosa para pesquisadores. Ouça sobre isso do desenvolvedor @noamteyssier:
39