Los científicos de bioinformática de Arc @noamteyssier y @a_dobin acaban de lanzar cyto, un procesador de ultra-alta capacidad optimizado específicamente para datos de células individuales de @10xGenomics Flex. Estamos emocionados de hacer que este recurso sea de código abierto:

En pruebas con un conjunto de datos Flex de 320,000 celdas, cyto completó el procesamiento en 13 minutos con un uso de memoria y disco sustancialmente más bajo, mientras producía resultados casi idénticos. Es importante destacar que estas mejoras provienen de la eficiencia algorítmica, no solo del paralelismo.

A medida que los conjuntos de datos de células individuales aumentan, las demandas de procesamiento crecen. cyto aprovecha la estructura fija de las bibliotecas Flex, lo que permite un procesamiento de datos más eficiente y hace que la plataforma sea aún más poderosa para los investigadores. Escucha sobre ello del desarrollador @noamteyssier: