Kaaribioinformatiikan tutkijat @noamteyssier ja @a_dobin ovat juuri julkaisseet cyto-prosessorin, erittäin korkean läpimenon prosessorin, joka on erityisesti optimoitu @10xGenomics Flex-yksisoludatalle. Olemme innoissamme voidessamme tehdä tästä resurssista avoimen lähdekoodin:

Testauksessa 320 000 solun Flex-aineistolla Cyto suoritti käsittelyn 13 minuutissa huomattavasti pienemmällä muistin ja levyn käytölle, mutta tulokset olivat lähes identtiset. Tärkeää on, että nämä hyödyt tulevat algoritmisesta tehokkuudesta, eivät pelkästään rinnakkaisuudesta.

Kun yksittäissoluaineistot kasvavat, prosessointivaatimukset kasvavat. cyto hyödyntää Flex-kirjastojen kiinteää rakennetta, mikä mahdollistaa tehokkaamman datankäsittelyn ja tekee alustasta entistä tehokkaamman tutkijoille. Kuule siitä kehittäjältä @noamteyssier: