Oamenii de știință în bioinformatică de la Arc, @noamteyssier și @a_dobin tocmai au lansat CYTO, un procesor ultra-high throughput optimizat special pentru date @10xGenomics Flex single-cell. Suntem entuziasmați să facem această resursă open source:
În testarea pe un set de date Flex de 320.000 de celule, cyto a finalizat procesarea în 13 minute cu o utilizare semnificativ mai mică a memoriei și discului, producând rezultate aproape identice. Este important de menționat că aceste câștiguri provin din eficiența algoritmică, nu doar din paralelism.
Pe măsură ce seturile de date cu o singură celulă cresc, cerințele de procesare cresc. cyto profită de structura fixă a bibliotecilor Flex, permițând o procesare a datelor mai eficientă și făcând platforma și mai puternică pentru cercetători. Află despre asta de la dezvoltatorul @noamteyssier:
26