Вчені з біоінформатики Arc @noamteyssier та @a_dobin щойно випустили cyto — процесор надвисокої пропускної здатності, спеціально оптимізований для даних @10xGenomics Flex з однією коміркою. Ми раді зробити цей ресурс відкритим кодом:

Під час тестування на наборі даних Flex з 320 000 комірок cyto завершив обробку за 13 хвилин із суттєво меншим використанням пам'яті та диска, при цьому даючи майже ідентичні результати. Важливо, що ці переваги походять від алгоритмічної ефективності, а не лише від паралелізму.

Зі збільшенням масштабування однокоміркових наборів даних зростають вимоги до обробки. cyto використовує фіксовану структуру бібліотек Flex, що забезпечує більш ефективну обробку даних і робить платформу ще потужнішою для дослідників. Почуйте про це від розробників @noamteyssier: