Ilmuwan bioinformatika Arc @noamteyssier dan @a_dobin baru saja merilis cyto, prosesor throughput ultra-tinggi yang secara khusus dioptimalkan untuk data sel tunggal Flex @10xGenomics. Kami sangat senang membuat sumber daya ini open source:

Dalam pengujian pada kumpulan data Flex 320.000 sel, cyto menyelesaikan pemrosesan dalam 13 menit dengan penggunaan memori dan disk yang jauh lebih rendah sambil menghasilkan hasil yang hampir identik. Yang penting, keuntungan ini berasal dari efisiensi algoritmik, bukan hanya paralelisme.

Seiring dengan meningkatnya kumpulan data sel tunggal, permintaan pemrosesan meningkat. cyto memanfaatkan struktur tetap perpustakaan Flex, memungkinkan pemrosesan data yang lebih efisien dan membuat platform menjadi lebih kuat bagi para peneliti. Dengarkan tentang hal ini dari @noamteyssier pengembang: