Die Bioinformatik-Wissenschaftler von Arc, @noamteyssier und @a_dobin, haben gerade cyto veröffentlicht, einen ultra-hochleistungsfähigen Prozessor, der speziell für die @10xGenomics Flex Einzelzell-Daten optimiert ist. Wir freuen uns, diese Ressource als Open Source zur Verfügung zu stellen:

Bei Tests mit einem Flex-Datensatz von 320.000 Zellen benötigte cyto 13 Minuten für die Verarbeitung, wobei der Speicher- und Festplattenspeicher erheblich geringer war und nahezu identische Ergebnisse erzielt wurden. Wichtig ist, dass diese Verbesserungen aus der algorithmischen Effizienz stammen und nicht nur aus der Parallelität.

Mit der Skalierung von Einzelzell-Datensätzen wachsen die Verarbeitungsanforderungen. cyto nutzt die feste Struktur der Flex-Bibliotheken, um eine effizientere Datenverarbeitung zu ermöglichen und die Plattform für Forscher noch leistungsfähiger zu machen. Hören Sie es vom Entwickler @noamteyssier: