Arcバイオインフォマティクスの科学者@noamteyssierと@a_dobinは、@10xGenomics Flex単一セルデータに特化した超高スループットプロセッサであるcytoをリリースしました。 このリソースをオープンソース化できることを楽しみにしています。

32万セルのFlexデータセットでテストしたところ、cytoは13分で処理を完了し、メモリとディスクの使用量を大幅に抑えつつ、ほぼ同じ結果を得ました。重要なのは、これらの利点は単なる並列処理ではなく、アルゴリズムの効率性から得られるということです。

シングルセルデータセットの拡大に伴い、処理の要求も増加します。CytoはFlexライブラリの固定構造を活用し、より効率的なデータ処理を可能にし、研究者にとってさらに強力なプラットフォームとなっています。 開発者@noamteyssierから話を聞こう: