Учёные-биоинформатики Arc @noamteyssier и @a_dobin только что выпустили cyto, процессор с ультравысокой пропускной способностью, специально оптимизированный для данных одноядерной обработки от @10xGenomics Flex. Мы рады сделать этот ресурс открытым исходным кодом:

В тестировании на наборе данных Flex с 320 000 ячейками, cyto завершил обработку за 13 минут с существенно меньшим использованием памяти и диска, при этом получив почти идентичные результаты. Важно отметить, что эти достижения обусловлены алгоритмической эффективностью, а не только параллелизмом.

По мере увеличения объемов данных одноядерных клеток растут требования к обработке. cyto использует фиксированную структуру библиотек Flex, что позволяет более эффективно обрабатывать данные и делает платформу еще более мощной для исследователей. Узнайте об этом от разработчика @noamteyssier: