Gli scienziati di bioinformatica di Arc @noamteyssier e @a_dobin hanno appena rilasciato cyto, un processore ad alta capacità di elaborazione specificamente ottimizzato per i dati a singola cellula di @10xGenomics Flex. Siamo entusiasti di rendere questa risorsa open source:

Nei test su un dataset Flex di 320.000 celle, cyto ha completato l'elaborazione in 13 minuti con un utilizzo di memoria e disco notevolmente inferiore, producendo risultati quasi identici. È importante notare che questi guadagni derivano dall'efficienza algoritmica, non solo dal parallelismo.

Man mano che i dataset a cellula singola aumentano, le esigenze di elaborazione crescono. cyto sfrutta la struttura fissa delle librerie Flex, consentendo un'elaborazione dei dati più efficiente e rendendo la piattaforma ancora più potente per i ricercatori. Ascolta il parere dello sviluppatore @noamteyssier: