Naukowcy z Arc bioinformatics, @noamteyssier i @a_dobin, właśnie wydali cyto, procesor o ultra-wysokiej przepustowości, specjalnie zoptymalizowany do danych z pojedynczych komórek @10xGenomics Flex. Cieszymy się, że możemy udostępnić ten zasób jako open source:

W testach na zbiorze danych Flex z 320 000 komórkami, cyto zakończyło przetwarzanie w 13 minut przy znacznie niższym zużyciu pamięci i dysku, jednocześnie produkując niemal identyczne wyniki. Co ważne, te zyski wynikają z efektywności algorytmu, a nie tylko z równoległości.

W miarę jak zestawy danych z pojedynczych komórek rosną, rosną również wymagania dotyczące przetwarzania. cyto wykorzystuje stałą strukturę bibliotek Flex, co umożliwia bardziej efektywne przetwarzanie danych i czyni platformę jeszcze potężniejszą dla badaczy. Posłuchaj o tym od dewelopera @noamteyssier: