Vědci z oblasti bioinformatiky Arc @noamteyssier a @a_dobin právě uvedli na trh cyto, ultra-výkonný procesor speciálně optimalizovaný pro @10xGenomics Flex jednobuněčná data. Jsme nadšeni, že tento zdroj můžeme učinit open source:
Při testování na datové sadě Flex o objemu 320 000 buněk Cyto dokončilo zpracování za 13 minut s výrazně nižší spotřebou paměti a disku, přičemž dosáhlo téměř identických výsledků. Důležité je, že tyto zisky přicházejí z algoritmické efektivity, nikoli jen z paralelismu.
S růstem jednobuňových datových sad rostou i požadavky na zpracování. cyto využívá pevnou strukturu Flex knihoven, což umožňuje efektivnější zpracování dat a činí platformu ještě výkonnější pro výzkumníky. Slyšte o tom od vývojáře @noamteyssier:
23