أطلق علماء المعلوماتية الحيوية في Arc @noamteyssier و@a_dobin مؤخرا Cyto، وهو معالج عالي الإنتاجية للغاية تم تحسينه خصيصا لبيانات خلية @10xGenomics Flex. نحن متحمسون لجعل هذا المورد مفتوح المصدر:
في اختبار على مجموعة بيانات فليكس مكونة من 320,000 خلية، أكملت سايتو المعالجة في 13 دقيقة مع استخدام ذاكرة وقرص أقل بكثير مع إنتاج نتائج شبه متطابقة. والأهم من ذلك، أن هذه المكاسب تأتي من الكفاءة الخوارزمية، وليس فقط من التوازي.
مع توسع مجموعات البيانات ذات الخلية الواحدة، تزداد طلبات المعالجة. تستفيد سايتو من البنية الثابتة لمكتبات فليكس، مما يتيح معالجة بيانات أكثر كفاءة ويجعل المنصة أكثر قوة للباحثين. استمع عن ذلك من المطور @noamteyssier:
‏‎24‏