Arc-bioinformatikkere @noamteyssier og @a_dobin har nettopp lansert cyto, en ultra-høygjennomstrømningsprosessor spesielt optimalisert for @10xGenomics Flex enkeltcelledata. Vi er begeistret for å gjøre denne ressursen åpen kildekode:

I testing på et Flex-datasett med 320 000 celler fullførte cyto behandlingen på 13 minutter med betydelig lavere minne- og diskbruk, samtidig som den produserte nesten identiske resultater. Viktig er det at disse gevinstene kommer fra algoritmisk effektivitet, ikke bare parallellisme.

Etter hvert som enkeltcelledatasett skalerer, øker behandlingsbehovene. cyto utnytter den faste strukturen i Flex-biblioteker, noe som muliggjør mer effektiv databehandling og gjør plattformen enda kraftigere for forskere. Hør om det fra utvikler @noamteyssier: