Científicos de bioinformática de Arc @noamteyssier y @a_dobin acaban de lanzar cyto, un procesador de ultra alto rendimiento optimizado específicamente para @10xGenomics datos de célula única Flex. Estamos entusiasmados de hacer este recurso de código abierto:

En pruebas sobre un conjunto de datos Flex de 320.000 celdas, cyto completó el procesamiento en 13 minutos con un uso sustancialmente menor de memoria y disco, produciendo resultados casi idénticos. Es importante destacar que estas ganancias provienen de la eficiencia algorítmica, no solo del paralelismo.

A medida que los conjuntos de datos de una sola célula aumentan, las demandas de procesamiento crecen. cyto aprovecha la estructura fija de las bibliotecas Flex, permitiendo un procesamiento de datos más eficiente y haciendo la plataforma aún más potente para los investigadores. Escucha sobre ello de la @noamteyssier desarrolladora: