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Die Tumormikroumgebung (TME) ist die Nachbarschaft um Krebszellen, die Immunzellen, Unterstützungszellen, Blutgefäße, Sauerstoff- und Nährstoffgradienten enthält. Sie steuert, wie Tumoren wachsen und sich gegen Medikamente wehren. Eine ordnungsgemäße Untersuchung erfordert räumliche Bildgebung (zu sehen, wo Zellen sitzen), was teuer und langsam ist.
Wie GigaTIME funktioniert, ist, indem es aus gepaarten Gewebebildern lernt, standardmäßigen H&E-Färbungen (günstige Präparate) und multiplexer Immunfluoreszenz (mIF) (teure, proteinbasierte Immunkarten). Es wurde mit 4 Petabyte Daten von über 50 Millionen Zellen trainiert.
Der Umfang ist riesig. Eine riesige virtuelle Tumorpopulation von 300.000 synthetischen Bildern über 24 Krebsarten und 306 Subtypen, die statistisch etwa 275.000 Patienten repräsentiert. Jetzt können wir auf Bevölkerungsebene studieren und verstehen, wie die Positionierung von Zelle zu Zelle die Arzneimittelresistenz beeinflusst, und alles ist öffentlich zugänglich.
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