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El microambiente tumoral (TME) es el vecindario alrededor de las células cancerosas que contiene células inmunitarias, células de soporte, vasos sanguíneos, gradientes de oxígeno y nutrientes. Controla cómo crecen los tumores y resiste los fármacos. Estudiar esto correctamente requiere imágenes espaciales (ver dónde se sitúan las células), lo cual es caro y lento.
El funcionamiento de GigaTIME es aprendiendo a partir de imágenes de tejidos emparejados, tinciones estándar de H&E (portaobjetos baratos) e inmunofluorescencia multiplex (mIF) (caros mapas inmunitarios a nivel de proteína). Se entrenó con 4 petabytes de datos de 50+ millones de celdas.
La escala es enorme. Una enorme población virtual de tumores de 300.000 imágenes sintéticas distribuidas en 24 tipos de cáncer y 306 subtipos, que estadísticamente representan unos 275.000 pacientes. Ahora podemos estudiar a escala poblacional y entender cómo el posicionamiento célula a célula afecta la resistencia a los fármacos, y todo es accesible públicamente.
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