قد يساعد المغنيسيوم في جعل فيتامين د كافيا. زاد تناول مكملات المغنيسيوم الجليسينات المخصصة (12 أسبوعا) من مستويات ميكروبين ينتجان فيتامين د في الأمعاء: C. maltaromaticum (بنسبة 23٪) وF. prausnitzii (بنسبة 2٪). كما رفعت مكملات المغنيسيوم مستويات 25(OH)D3 في الأمعاء، لكن التغيرات في هذه الميكروبات لم تفسر زيادة فيتامين د، مما يشير إلى أن المغنيسيوم يساعد على الأرجح فيتامين د كعامل إنزيمي إضافي، ومن المحتمل أن يدعم الميكروبات المنتجة لفيتامين د في الأمعاء المحلية.