Le codage prédictif cadre l'autisme et la schizophrénie comme des déséquilibres entre le traitement descendant et le traitement ascendant. L'autisme peut favoriser l'entrée sensorielle ascendante, conduisant à une concentration sur les détails et à une surcharge sensorielle. La schizophrénie peut favoriser les croyances descendantes, conduisant à des hallucinations et des délires.