Một protein giúp ổn định các mRNA ức chế ung thư hóa ra là một phanh chính trong sự di căn của ung thư vú. Một bài báo từ Nhà nghiên cứu chính @genophoria và phòng thí nghiệm trong @ScienceAdvances đã truy tìm cơ chế này đến sự phân hủy RNA và một protein gắn RNA mà hầu hết các nghiên cứu đã bỏ qua.

Biểu hiện gen trong các khối u thường được quy cho các thay đổi di truyền và biểu sinh. Nhưng khi nhóm nghiên cứu phân tích tỷ lệ phân hủy RNA trên sáu dòng tế bào ung thư vú, chỉ riêng việc phiên mã đã để lại một phần lớn sự biến đổi trong biểu hiện chưa được giải thích. Khoảng trống đó chỉ ra sự ổn định của mRNA.

Để xác định các cơ quan quản lý đứng sau nó, nhóm đã phát triển GreyHound, một mô hình học sâu dự đoán độ ổn định của bản sao từ các đặc điểm chuỗi RNA và sự biểu hiện của protein liên kết RNA (RBP) đồng thời trên các loại tế bào.

Nhà quản lý được dự đoán hàng đầu là RBMS3. CLIP-seq đã xác nhận sự liên kết trực tiếp tại các yếu tố 3'UTR giàu AUA; các thử nghiệm báo cáo cho thấy những vị trí đó là cần thiết và đủ; SLAM-seq xác nhận rằng hiệu ứng này là sau phiên mã, không phải phiên mã.

Về mặt chức năng, sự mất mát RBMS3 đã làm tăng sự di căn phổi trong hai mô hình xenograft độc lập. Một cuộc khảo sát CRISPRi in vivo sau đó đã xác định TXNIP, một chất ức chế khối u, là yếu tố chính. Các thí nghiệm epistasis đã xác nhận RBMS3 hoạt động ở phía trên TXNIP để ức chế sự di căn.

Phòng thí nghiệm Goodarzi đang tuyển dụng một nghiên cứu sinh sau tiến sĩ hợp tác. Xem các vị trí mở của Arc: