يتضح أن بروتين يثبت الحمض النووي الريبي الريبي المضبط للسرطان هو عامل رئيسي في انتشار سرطان الثدي. ورقة بحثية من Core Investigator @genophoria ومختبر في @ScienceAdvances تتبع الآلية إلى تحلل الحمض النووي الريبي وبروتين مرتبط بالحمض النووي الريبي الذي أغفلته معظم الدراسات.

عادة ما يعزى التعبير الجيني في الأورام إلى التغيرات الجينية والجينية فوق الجينية. لكن عندما قام الفريق بتحليل معدلات تحلل الحمض النووي الريبي عبر ستة خطوط خلايا لسرطان الثدي، ترك النسخ وحده حصة كبيرة من تباين التعبير دون تفسير. تشير تلك الفجوة إلى استقرار الرنا المغناطيسي المغناطيسي.

لرسم خريطة المنظمين وراء ذلك، طور الفريق نموذج GreyHound، وهو نموذج تعلم عميق يتنبأ باستقرار النسخ من ميزات تسلسل الحمض النووي الريبي وتعبير بروتين ارتباط الحمض النووي الريبي (RBP) في نفس الوقت عبر أنواع الخلايا.

كان أعلى جهة تنظيمية متوقعة هي RBMS3. أكد CLIP-seq الارتباط المباشر بعناصر 3'UTR الغنية ب AUA؛ أظهرت اختبارات الصحفيين أن تلك المواقع ضرورية وكافية؛ أكد SLAM-seq أن التأثير بعد النسخ وليس نسخيا.

وظيفيا، زاد فقدان RBMS3 من استعمار الرئة النقيلي في نموذجين مستقلين لزراعة زينو. ثم حدد فحص CRISPRi في الجسم الحي، TXNIP، وهو مثبط للورم، كعامل رئيسي. أكدت تجارب الإبستاسيس أن RBMS3 يعمل في اتجاه TXNIP لكبح النقائل.

يقوم مختبر جودارزي بتوظيف زميل ما بعد الدكتوراه المشترك. انظر الأدوار المفتوحة في Arc: