予測コーディングは自閉症や統合失調症を、トップダウンとボトムアップの処理の不均衡として捉えています。自閉症はボトムアップの感覚入力を好み、細部への注目や感覚過負荷につながることがあります。統合失調症はトップダウンの信念を好む傾向があり、幻覚や妄想を引き起こすことがあります。