Prediktiv koding rammer inn autisme og schizofreni som ubalanser i top-down vs. bottom-up prosessering. Autisme kan favorisere sensorisk input nedenfra og opp, noe som fører til fokus på detaljer og sensorisk overbelastning. Schizofreni kan favorisere ovenfra-og-ned-tro, noe som fører til hallusinasjoner og vrangforestillinger.