Ulkoministeriön poliittisten asioiden osasto on sen CIA:n merkittävin osasto. JFK:n tiedostot listasivat 48 % ulkoministeriön poliittisista asioista CIA:n peitehenkilöiksi. Bill Burns oli poliittisten asioiden johtaja ja myöhemmin CIA:n johtaja. Victoria Nuland oli poliittisten asioiden johtaja ja työskentelee nyt NED:ssä