Uma proteína que estabiliza mRNAs supressores de câncer revela-se um travão chave na metástase do câncer de mama. Um artigo do Investigador Principal @genophoria e laboratório em @ScienceAdvances rastreia o mecanismo até a degradação do RNA e uma proteína de ligação ao RNA que a maioria dos estudos ignorou.

A expressão gênica em tumores é tipicamente atribuída a mudanças genéticas e epigenéticas. Mas quando a equipe analisou as taxas de degradação do RNA em seis linhagens celulares de câncer de mama, a transcrição sozinha deixou uma grande parte da variabilidade da expressão inexplicada. Essa lacuna apontou para a estabilidade do mRNA.

Para mapear os reguladores por trás disso, a equipe desenvolveu o GreyHound, um modelo de aprendizado profundo que prevê a estabilidade do transcrito a partir de características da sequência de RNA e da expressão de proteínas ligadoras de RNA (RBP) simultaneamente em diferentes tipos celulares.

O principal regulador previsto foi o RBMS3. O CLIP-seq confirmou a ligação direta em elementos 3'UTR ricos em AUA; ensaios de repórter mostraram que esses locais são necessários e suficientes; o SLAM-seq confirmou que o efeito é pós-transcricional, não transcricional.

Funcionalmente, a perda de RBMS3 aumentou a colonização metastática pulmonar em dois modelos de xenotransplante independentes. Um rastreio in vivo de CRISPRi identificou então o TXNIP, um supressor tumoral, como o efetor chave. Experimentos de epistase confirmaram que o RBMS3 atua a montante do TXNIP para suprimir a metástase.

O Laboratório Goodarzi está a recrutar um bolseiro de pós-doutoramento conjunto. Veja os cargos abertos na Arc: