Kodowanie predykcyjne przedstawia autyzm i schizofrenię jako nierównowagi w przetwarzaniu od góry do dołu w porównaniu do przetwarzania od dołu do góry. Autyzm może faworyzować sensoryczne dane z dołu, co prowadzi do skupienia na szczegółach i przeciążenia sensorycznego. Schizofrenia może faworyzować przekonania od góry do dołu, co prowadzi do halucynacji i urojeni.