Prediktivní kódování rámuje autismus a schizofrenii jako nerovnováhu v zpracování shora dolů vs. zdola nahoru. Autismus může upřednostňovat smyslový vstup zdola nahoru, což vede k zaměření na detaily a smyslovému přetížení. Schizofrenie může upřednostňovat přesvědčení shora dolů, což vede k halucinacím a bludům.